VS 2008 Multi-Targeting Support
VS 2008ではプロジェクトを作成する段階でフレームワークのバージョンを選択できるようになります。
ASP.NETの場合は2.0と3.0では特に変更がないので、2.0と3.5を選んだ場合の変化等についてまとめられています。
この記事の中で、2.0ベースの開発をするのにVS2005を使わずに2008を使う理由がいつくか述べられてますが、その中にさらっと
・Nested ASP.NET master page support at design-time
なんて記述があったりします（ｗ
やっとサポートされるんですね。
上記記事ではWebプロジェクトの作り方だけが載ってますが、Orcas Beta1で見る限りWebサイトでも同様にフレームワークのバージョンを選択して作成できるようになっています。